また、コケ植物・シダ植物・種子植物も光合成色素がこの群と共通である。したがって、これらの高等植物が緑藻類のどれかを祖先として進化したものであると考えられるが、これも諸説あって現在のところは不明である。
共通の特徴としては、光合成色素の他に、遊走細胞が鞭状鞭毛を複数持つことがあげられる。しかし、鞭毛根構造の形態の多様性などから異質な細胞構造を持ついくつもの多系統のものを含んでいると考えられ、分類の扱いは諸説ある。
一般には原生生物界に所属させるが、上記の細胞構造がコケ植物や維管束植物と一致し、これらと単系統を構成すると考えられる一部のグループを植物界に所属させる考えもある。

